Merlin est un magicien que l'on rencontre dans le Grand Classique qui porte son nom, Merlin l'Enchanteur. C'est un vieil homme à la longue barbe blanche, portant un costume et un long chapeau pointu bleus, et qui vit reculé dans une cabane dans une forêt d'Angleterre. Si c'est un grand magicien, il utilise sa magie uniquement dans un but bénéfique. Il est accompagné d'Archimède, son hibou instruit.

Parmi ses facultés, Merlin sait animer des objets, les miniaturiser pour les faire tenir dans une valise, et surtout prédire l'avenir et savoir ce qui va se produire. Il annonce ainsi l'arrivée d'Arthur (Moustique) dans sa cabane, ce qui se produit. Faisant la connaissance du jeune garçon, il décide de le suivre et de faire son éducation. Il l'entraîne à développer ses connaissances et ses expériences de la vie en le transformant en trois sortes d'animaux : poisson, puis écureuil et enfin oiseau. Grâce à ses conseils, Moustique évite tous les dangers et apprend que "l'intelligence vous donne la vraie puissance".

Le duel de magie opposant Merlin à Madame Mim est une des scènes les plus connues de Merlin l'Enchanteur et une scène d'animation très réussie du film. Il consiste à ce que l'un des deux détruise l'autre en se transformant grâce à sa magie. Madame Mim énonce elle-même les règles : 1. Ni en minéral ni en végétal, rien qu'en animal ; 2. Toujours des animaux existants ; 3. Interdit de disparaître. Merlin a beau énoncer la règle 4. Pas de tricherie, Madame Mim ne les respectera pas en disparaissant, puis en se transformant en dragon...

Pendant le duel, Madame Mim et Merlin se transforment en 8 animaux différents, avant que Merlin ne remporte la victoire en devenant un virus très virulent qui contamine Madame Mim. Voici un rappel des transformations :

Lorsqu'il est devenu un oiseau, moustique s'égare dans la forêt et attérit dans la cheminée de la maison de Madame Mim, une magicienne qui préfère utiliser sa magie pour de mauvaises actions. Elle provoque Merlin en duel pour voir qui est le plus puissant des magiciens (voir ci-dessous). Encore une fois, Merlin se montre le plus intelligent.

Alors que Moustique apprend à Merlin qu'il va devenir écuyer de Kay, Merlin s'emporte de voir son protégé abandonner ses études et s'envole pour Saint-Trop, une plage de la Méditerranée pas encore inventée. Il revient lorsqu'Arthur est devenu roi d'Angleterre.

A Disneyland Paris, Merlin n'apparaît que lors de parades et spectacles. On peut ainsi le voir lors des Fêtes Pas-Si-Trouille de Mickey pendant la période d'Halloween, lors du spectacle Merlin et l'Académie des Sorcières, sur la place derrière le château.