Kuzco est le personnage principal du Grand Classique Kuzco, l'Empereur Mégalo. Jeune Empereur égocentrique, arrogant et juvénile, il ne pense qu'à lui et ne se soucie guère du bien-être de ses sujets, comme les pauvres paysans qui meurent de faim. Dans son somptueux palais, il n'a qu'à claquer des doigts pour obtenir ce qu'il veut de ses domestiques.

Alors qu'il s'apprête à avoir 18 ans, Kuzco reçoit Pacha, un chef de village situé sur une colline et lui annonce qu'il va tout y détruire pour construire Kuzcotopia, sa nouvelle résidence grand luxe avec piscine. Mais les plans de l'Empereur vont être compromis par Yzma, sa conseillère qu'il vient de renvoyer. La vieille femme, aidée de son bras droit Kronk, veut prendre la place de l'Empereur et régner sur l'Empire. Elle décide de l'éliminer en lui faisant boire du poison, mais la fiole n'est pas la bonne et Kuzco est transformé en lama.

Arrivé dans un sac chez Pacha de retour dans son village, Kuzco croit que ce dernier est responsable da sa transformation et le charge de le ramener au palais. S'en suit alors une série d'aventures dans la jungle et une course contre Yzma à sa poursuite jusqu'au palais...